A kedvező bélmikroflórát hátrányosan befolyásolhatja vagy csökkentheti a rostszegény étrend, a magas állati fehérje, a drogfogyasztás, az utazás és a stressz stb. Ennek eredményeként dysbiosis (azaz a bél mikroflóra felborulása) alakul ki, ami károsan befolyásolhatja a gyomor-bélrendszer immunrendszerét. funkciókat.